首都医科大学附属北京世纪坛医院
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陈晨研究员

擅长:

病原基因组学,生物信息学。

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个人简介 学术任职 主研方向 获奖情况 学术论著

[职称] 教授,研究员

[学位] 博士研究生

教育背景/工作经历

1998.09~2002.07 北京大学 生物学、计算机软件工程 学士

2003.09~2008.07 中国科学院北京基因组研究所 遗传学 博士

2002.08~2009.09 华大基因 负责人 研究实习员

2009.09~2015.01 中国疾病预防控制中心传染病所 副主任 副研究员

2015.02~2021.03 首都医科大学附属北京地坛医院 教授 研究员

2021.04~至今 首都医科大学附属北京世纪坛医院 教授 研究员

联系方式

联系电话:010-63926977

电子信箱:chenchen1@ccmu.edu.cn 

中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会 常务委员

中国生物工程学会生物信息学分会 常务委员

中国微生物学会微生物生物安全专业委员会 青年常务委员

主要研究方向是以病原遗传进化为研究主线,关注宿主(患者)个体内病原变异的异质性,通过开发病原基因组学新技术和生物信息学算法研究为突破,系统、动态、全面的研究病原微生物变异在个体内由低丰度到高丰度发生、筛选、累积和传播过程,从而明确病原在宿主内变异的分子机制,以推动重新构建病原遗传变异、感染与免疫机理,解析病原-宿主相互作用与进化的本质。

北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养计划 北京市卫计委 

北京市科技新星计划 北京市科委

先后获得了国家自然科学基金2项,国家自然科学基金重点项目子课题1项,国家科技部863计划子课题1项。2019年,独立主持了国家科技部重点项目中英合作计划。近10年,作为第一作者和通讯作者(含共同),发表SCI论文60余篇,单篇最高影响因子24.5,总引用3000余次。主要代表性论文包括: Cell子刊3篇(Cell Metabolisms, Molecular Cell及Cell Reports),Nature 子刊2篇(Nature Microbiology及Nature Communication),临床代表性论文4篇(Annals of Internal Medicine, Clinical Infectious Diseases及Lancet Infectious Diseases)和国内卓越期刊3篇(National Science Review, Innovation 及Genomics Proteomics Bioinformatics)等。

代表性论文:

1. Li J#, Du P#, Yang L#, Zhang J#, Song C#, Chen D#, Song Y, Ding N, Hua M, Han K, Song R, Xie W, Chen Z, Wang X, Liu J, Xu Y, Gao G, Wang Q, Pu L, Di L, Li J, Yue J, Han J, Zhao X, Yan Y, Yu F, Wu AR, Zhang F*, Gao YQ*, Huang Y*, Wang J*, Zeng H*, Chen C*. Two-step fitness selection for intra-host variations in SARS-CoV-2. Cell Rep. 2022 Jan 11;38(2):110205. doi: 10.1016/j.celrep.2021.110205. Epub 2021 Dec 16. PMID: 34982968; PMCID: PMC8674508.

2. Li NN#, Li W#, Feng JX#, Zhang WW, Zhang R, Du SH, Liu SY, Xue GH, Yan C, Cui JH, Zhao HQ, Feng YL, Gan L, Zhang Q, Chen C*, Liu D*, Yuan J*. High alcohol-producing Klebsiella pneumoniae causes fatty liver disease through 2,3-butanediol fermentation pathway in vivo. Gut Microbes. 2021 Jan-Dec;13(1):1979883. doi: 10.1080/19490976.2021.1979883. PMID: 34632939; PMCID: PMC8510565.

3. Chen Chen#, Guiju Gao#, Yanli Xu#, Lin Pu#, Qi Wang#, Liming Wang#, Wenling Wang, Yangzi Song, Meiling Chen, Linghang Wang, Fengting Yu, Siyuan Yang, Yunxia Tang, Li Zhao, Huijuan Wang, Yajie Wang, Hui Zeng*, Fujie Zhang*. 2020. Sars-Cov-2–Positive Sputum and Feces after Conversion of Pharyngeal Samples in Patients with Covid-19. Annals of Internal Medicine. 2020 Jun 16;172(12):832-834. doi: 10.7326/M20-0991. Epub 2020 Mar 30. PMID: 32227141; PMCID: PMC7133055.

4. Chen C#, Li J#, Di L#, Jing Q#, Du P#, Song C, Li J, Li Q, Cao Y, Xie XS, Wu AR*, Zeng H*, Huang Y*, Wang J*. MINERVA: A Facile Strategy for SARS-CoV-2 Whole-Genome Deep Sequencing of Clinical Samples. Mol Cell. 2020 Dec 17;80(6):1123-1134.e4. doi: 10.1016/j.molcel.2020.11.030. Epub 2020 Nov 20. PMID: 33290743; PMCID: PMC7678446.

5. Ju Zhang#, Nan Ding#, Lili Ren#, Rui Song#, Danying Chen#, Xuesen Zhao, Budong Chen, Junyan Han, Jiarui Li, Yangzi Song, Lin Di, Kai Han, Fengting Yu, Ruming Xie, Zhihai Chen, Wen Xie, Jingyuan Liu, Shan Cen, Yuhai Bi, Angela R Wu*, Fujie Zhang*, Chen Chen*, Hui Zeng*, COVID-19 reinfection in the presence of neutralizing antibodies, National Science Review, nwab006.

6. Pengcheng Du#, Nan Ding#, Jiarui Li#, Fujie Zhang#, Qi Wang#, Zhihai Chen#, Chuan Song, Kai Han, Wen Xie, Jingyuan Liu, Linghang Wang, Lirong Wei, Shanfang Ma, Mingxi Hua, Fengting Yu, Lin Wang, Wei Wang, Kang An, Jianjun Chen, Haizhou Liu, Guiju Gao, Sa Wang, Yanyi Huang, Angela R. Wu, Jianbin Wang*, Di Liu*, Hui Zeng* & Chen Chen*. Genomic surveillance of COVID-19 cases in Beijing. Nat Commun 11, 5503 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-19345-0.

7. Pengcheng Du#, Chuan Song#, Rui Li#, Yangzi Song#, Jiarui Li, Nan Ding, Ju Zhang, Rui Song, Junyan Han, Guiju Gao, Jinglin Yue, Ang Duan, Yanyi Huang, Jing An, Jianbin Wang*, Fujie Zhang*, Chen Chen*, Hui Zeng*. Specific Redistribution of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants in the Respiratory System and Intestinal Tract. Clinical Infectious Diseases, ciaa1617.

8. Jing Yuan#,*, Chen Chen#, Jinghua Cui#, Jing Lu#, Chao Yan#, Xiao Wei, Xiangna Zhao, NanNan Li, Shaoli Li, Guanhua Xue, Weiwei Cheng, Boxing Li, Huan Li, Weishi Lin, Changyu Tian, Jiangtao Zhao, Juqiang Han, Daizhi An, Qiong Zhang, Hong Wei, Minghua Zheng, Xuejun Ma, Wei Li, Xiao Chen, Zheng Zhang, Hui Zeng, Sun Ying, JianXin Wu, Ruifu Yang*, Di Liu*. 2019. Fatty Liver Disease Caused by High-Alcohol-Producing Klebsiella pneumoniae. Cell Metabolism, 30(4): 675-688.e7.

9. Du P, Zhang Y, Chen C*. 2018. Emergence of carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae. Lancet Infect Dis, 18(1):23-4.

10. Ni M#, Chen C#, Qian J#, Xiao HX, Shi WF, Luo Y, Wang HY, Li Z, Wu J, Xu PS, Chen SH, Wong G, Bi Y, Xia ZP, Li W, Lu HJ, Ma J, Tong YG, Zeng H, Wang SQ*, Gao GF*, Bo XC*, Liu D*. 2016. Intra-host dynamics of Ebola virus during 2014. Nat Microbiol, 1(11):16151.